Câu chuyện xoay quanh một học sinh trung học năm thứ nhất, Teiichi Niiya vừa đăng ký học tại Học viện tư thục Seikyou. Khi lạc vào một trong những tòa nhà cũ của trường, anh gặp một cô gái tên Yuuko Kanoe, người tiết lộ mình là một hồn ma không có ký ức. Teiichi sau đó quyết định điều tra cái chết của cô bằng cách đào sâu vào Bảy bí ẩn khét tiếng của ngôi trường nhiều tầng cùng với Kirie Kanoe, họ hàng của Yuuko và Momoe Okonogi năm thứ hai hay quên. Xuyên suốt câu chuyện, Teiichi và Yuuko khám phá sự thật về những câu chuyện ma quái này và giúp đỡ những người đang gặp rắc rối đồng thời tiến gần hơn đến sự thật đằng sau cái chết của Yuuko.